1、表现形态不同。
企业法人注销是企业主动通过书面材料，提交有关文件、证件自行向登记机主管机关申请终止市场经济活动和民事关系的登记行为，是企业登记管理中的专有名词。而破产是被动的，是企业经营不下去，资不抵债，也就是亏损到把借来的钱也赔进去了，按照破产法不得不进行企业终结的行为。
2、行为结果不同。
企业法人注销标志着该企业完结债权、债务清理，或民事关系引起的民事诉讼已有了明确的了断，企业的法人地位不复存在，实现了真正意义上消亡。而破产企业标致着该企业由于资不抵债而被强制剥夺经营资格，应当依法进行清算，清算完毕后办理注销登记。
3、执法程序不同。
申请注销，公司股东要履行清算程序，要进行公告，要履行完债权债务。申请破产，要由法院组织进行，召开债权人会议，选择破产清算人。
《公司法》第183条的相关规定，依法清算是一种法定义务，有限责任公司的股东必须履行，其目的在于解决公司出现解散事由悬而不决的状态，同时清理公司的债权债务，以保护债权人的合法权益。
按照《公司法》第185条及《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》第11条的相关规定，公司依照法定清算程序后注销，但清算组成员违法未向债权人履行通知义务或履行通知义务不合法的，债权人有权要求清算组成员直接承担赔偿责任。