如何设计PCR引物

作者:哈哈小脸 | 创建时间: 2023-06-10
在科研中,PCR是最基础的实验操作,如何设计特异性好的PCR的引物呢?...
如何设计PCR引物

操作方法

首先要下载自己的模板序列,即PCR扩增的模板,一般是通过NCBI提交的基因序列为准。

模板序列确定了以后,就是通过primer5.0分析其反向互补序列,并且通过primer5.0筛选出得分比较高的几对引物。

然后打开oligo6.0,在此软件中打开自己的模板序列,输入筛选出的几对引物,对其引物长度,二级结构,退火温度和碱基组成等进行分析。一般我们选择18-25bp长度的引物,退火温度60度左右。

最后打开NCBI,通过blast自己的引物,得出特异性大小的分析。

温馨提示

总体来说经过这几步骤选择的引物特性性较好,PCR效率较高。
在实验中要摸索PCR反应的最佳退火温度和最适模板浓度。
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