怎样使用PubMed查找某个基因的mRNA编码区序列?

作者:清风拂面 | 创建时间: 2023-07-22
在设计PCR引物时,通常需要知道打算扩增的基因mRNA编码区的序列信息。在这里,以常见的小鼠beta-actin基因为例,向大家介绍一种使用PubMed数据库查找其mRNA编码区序列的简单方法,希望能帮到大家!...
怎样使用PubMed查找某个基因的mRNA编码区序列?

操作方法

打开PubMed首页。

在PubMed首页中,把检索框左边的数据库改成“gene”,检索框中输入“beta-actin mouse”,然后点击search。

在新打开的页面中可以看到,第一项的别名(Aliases)里面有“beta-actin”,所以它就是我们要查找的beta-actin基因,它的名称显示的是“Actb”,点击打开。

新打开的页面就是小鼠beta-actin基因的详细信息。点击页面右侧的“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”或者直接向下滚动页面,到达序列目录。

在如图所示的序列目录,以NM开头的一串序列就是mRNA的序列。打开它。

打开的页面就是小鼠beta-actin基因的mRNA的详细信息。向下滚动页面,找到CDS序列并点击它。

在新出现的页面中,标棕色的就是小鼠beta-actin基因的mRNA序列。可以以它为模板,设计PCR引物。

温馨提示

基因的名称可能不止有一种,有的基因有多种别名。如果在搜索到的基因列表里面没有找到所查询的基因,要注意看看所查到的基因的别名。
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