操作方法
新版通行证采用了符合国际标准的高安全性集成电路芯片，与电子普通护照相似，可存储持证人个人资料及证件、签注签发管理信息，并使用成熟的数字化防伪安全机制进行保护。
过关时刷卡可验放，无须盖章，同时，存取个人指纹信息的居民，将按规定自助通关。过关时长大概在8秒~10秒。
成人电子往来港澳通行证有效期延长为10年，对未满16周岁的仍签发5年有效通行证。
对首次申请电子往来港澳通行证的16周岁以上（含）的申请人，内地公安机关出入境管理部门将采集或核验指纹，16周岁以下的申请人是否采集指纹根据其监护人的意见确定；如持证人希望免登记使用港澳地区自助查验通道通关，还应在申请电子往来港澳通行证时签署《免登记使用港澳地区自助查验通道声明》（不满16周岁的由其监护人签署）。
往来港澳签注不再采取贴纸的方式，而是直接打印在证件背面，可重复擦写。
电子往来港澳通行证启用后，内地居民往来港澳地区的管理政策不变，证件申请受理渠道和审批条件不变，收费标准不变。
除了留存或核验指纹信息外，电子通行证和签注的申办渠道、程序及相关的资格、条件与现行往来港澳通行证、签注完全一致。
现行本式往来港澳通行证和签注在有效期内可以继续使用，持本式通行证可以继续申办贴纸式签注。
方法/步骤2
两个情况，市民需注意！
为方便持证人掌握签注的使用情况，内地公安机关出入境管理部门将向持证人提供电子往来港澳通行证签注剩余次数的查询服务并可为持证人打印提示条。港澳地区主管部门将在其总部及部分口岸（主要是海港码头口岸）设置自助咨询台，为持证人本人提供查询签注信息服务。相关资料通过计算机屏幕供持证人阅读，不提供打印的提示条。
证件背面的二维码有何用途？ 证件背面的签注信息除了文字内容外，同时也用二维码方式体现。这个二维码是供管理部门在必要的情况下使用的，例如在口岸查验过程中，如果出现证件芯片损坏的情况，可以通过二维码来读取签注信息进行验放。