如何使用序列比对软件mega 6

首先，要讲一条使用mega打开序列文件的技巧: 直接将要分析的文件拖到mega软件的图标上，然后就是下面这个界面了。

在第一列选中序列名称，就可以对序列名称进行编辑，剪切和删除的修改。

此外，点击Species/Abbrv，可以对序列按名称顺序进行排列，非常方便。

点击顶部功能栏的Alignment，一般选择下面的第一个，cluster w,也可以直接选择顶部一个大写 W 的快捷键，进行序列比对。

接下来，软件会提示，没有序列被选中，是否选择所有序列，点击ok选择所有序列进行比对。

接下来，会弹出一个参数设置的界面，我们一般不做修改，直接点击ok，进行下一步。

之后，会出现下面这个界面，显示序列比对的进度。

序列比对完成以后，我们可以通鼠标过拖动序列顶部来选中不同的列，进行删除，以达到截齐比对结果两端的目的（非必需步骤），大致就是这样。关于构建进化树的功能将在后面讲到。